ด้วยขนาดราษฎรที่เพิ่มสูง รวมทั้งการเจริญเติบโตของอุตสาหกรรมอย่างเร็วก่อปัญหาสภาพแวดล้อมที่รุนแรง
MGWIN88 ปัญหาเกิดขึ้นได้เพราะมีสาเหตุเนื่องมาจากการจัดการที่อ่อนแอแล้วก็การมีทรัพยากรไม่พอ ปัญหาต่างๆดังเช่น การทำลายพื้นที่พรุ การทำลายป่า นำมาซึ่งหมอกควันปกคลุมทั่วเอเซียอาคเนย์ การใช้คุณประโยชน์ทรัพยากรทางทะเลมากจนเกินไป มลภาวะทางอากาศ การจัดการขยะรวมทั้งน้ำเสียที่ไร้คุณภาพ มีส่วนทำให้อินโดนีเซียอยู่ในชั้นต่ำ ในดรรชนีผลจากการดำเนินงานด้านสภาพแวดล้อมปี 2020 จัดว่าน้อยกว่าค่าถัวเฉลี่ยทั้งยังในระดับภูมิภาคและก็ระดับนานาชาติ ในปี 2018 ป่าดงครอบคลุมพื้นที่ราวๆ 49.7% ของพื้นที่ประเทศ น้อยลงจาก 87% ในปี 1950 เริ่มในปี 1970 แล้วก็สม่ำเสมอมาจนกระทั่งเดี๋ยวนี้ การสร้างท่อนไม้ พื้นที่สำหรับเพาะปลูกรวมทั้งทำการเกษตรต่างๆส่งผลต่อการตัดต้นไม้ทำลายธรรมชาติส่วนมากในอินโดนีเซีย ทำให้อินโดนีเซียเป็นแหล่งปลดปล่อยก๊าสสภาวะเรือนกระจกที่ใหญ่ที่สุดในโลก ยิ่งกว่านั้นยังรุกรามการดำรงชีวิตของสิ่งมีชีวิต
MGWIN88 หน่วยงานระหว่างชาติเพื่อการอนุรักษ์และรักษาธรรมชาติ กล่าวว่าสัตว์กินนม 140 สายพันธุ์ถูกรุกราม รวมทั้งอีก 15 สายพันธุ์กำลังเสี่ยงขั้นวิกฤติต่อการหมดสิ้นเผ่าพันธุ์ รวมทั้งนกเกาะบาหลี ลิงอุรังอุตังเกะสุมาตรา รวมทั้งแรดชวา
